Méthodes d'étude des champignons endophytes et de leurs activités biologiques : Synthèse bibliographique.

Abstract

L’objectif de ce travail est de connaitre les méthodes utilisées pour l’étude des champignons endophytes impliquant leur isolement, leur identification, l’extraction et l’identification de leurs métabolites secondaire bioactifs ainsi que l’évaluation des activités biologiques de ces dernières. Avant tout isolement des champignons endophytes, une stérilisation de la surface des différentes parties de plantes est nécessaire, une sélection des champignons les plus actifs, est ensuite le plus souvent réalisé en utilisant les méthodes de la double culture et des cylindres d’agar. Les endophytes les plus actifs sont identifié premièrement morphologiquement ensuite moléculairement pour plus de précision. Après l’extraction des métabolites secondaire bioactifs produits par ces champignons, leurs séparation et identification, sont réalisées par différentes méthodes, telles que la chromatographie surcouche mince et en phase liquide à haute performance. Enfin la détermination des différentes activités biologiques des molécules bioactives est estimée, pour l’activité antimicrobienne parla méthode de diffusion sur disque, des puits, l’autobiographie et la détermination des concentrations minimales inhibitrices et bactéricides. Concernant l’activité antioxydante, les méthodes les plus utilisées est l’activité de piégeage du radical 1, 1- diphenyl-2-picryl-hydrazyl et le test du pouvoir réducteur. Pour les activités antivirale et anticancéreuse on utilise la colorimétrie, alors que l’activité antiparasitaire est déterminée soit par la capacité des molécules actives à inhiber les gGAPDH et APRT soit en utilisant des cultures cellulaires infectées par le parasite et en mesurant le taux de viabilité de ces dernières après leur traitement par les molécules fongiques. Mots Clés : Champignons endophytes, activité antimicrobienne, activité antioxydante, activité antivirale, activité antiparasitaire, activité anticancéreuse.