Champignons endophytes : un puissant agent de lutte biologique et un réservoir de métabolites secondaires bioactifs

Abstract

Les champignons endophytes constituent un groupe polyphylétique très diversifié, principalement constitué d’espèces issues des Ascomycètes. Leur mode de vie se caractérise par une phase dite endophytique consistant en la colonisation asymptomatique des structures internes d'une plante, pendant au moins une partie de leur cycle de vie. Toutes les plantes dans les écosystèmes naturels semblent établir des relations avec des champignons endophytes, des tropiques jusqu’aux pôles. Depuis une cinquantaine d’années, leur étude s’est progressivement intensifiée suite à la découverte D’une part, de leur implication dans de nombreuses toxicoses observées dans l’élevage, et d’autre part de leur capacité à produire une molécule anticancéreuse, le Paclitaxel, principe actif du Taxol®, médicament blockbuster de l’industrie pharmaceutique.et d’autre substances à utilisation potentielle en médecine, en agriculture ou en industrie. Ce travail vise à étudier les champignons endophytes dont l'origine est leur classification et leur mode de reproduction, en particulier leur effet sur les écosystèmes (un facteur de contrôle biologique fort) et leur capacité à produire des matériaux thérapeutiques (réservoir de métabolites secondaires biologiquement actifs.) A travers ce travail, nous avons traité la phylogénie des endophytes et de leurs hôtes, les interactions entre le champignon endophyte et la plante hôte, l'impact de ces endophytes sur la diversité végétale et le fonctionnement des écosystèmes Plusieurs molécules bioactives produites par ces champignons sont également discutées, dont certaines ont des propriétés curatives qui peuvent être utilisées contre un grand nombre de maladies. Enfin, nous avons discuté des méthodes et techniques utilisées pour étudier ces champignons endophyte, en commençant par le prélèvement d'échantillons et la détermination du type de champignon au microscope et au niveau moléculaire jusqu'à la séparation des métabolites secondaires actifs et l'étendue de leurs activités contre certaines bactéries, champignons et levures. Mots clés: champignons endophytes, activité antifongique, antagoniste, métabolites secondaires.